阮文岳当皇帝，两个兄弟当割据的藩王，这种政治结构注定不会长远。

很快阮文惠就开始自行其是，派兵北伐，打到升龙（河内），推翻了郑氏，拜见名义上的国王黎朝显宗，接受显宗封为元帅扶正翊运威国公。

此时西山王朝的内斗开始了，阮文岳不满弟弟阮文惠擅自北上，便亲自北上，与黎愍宗（新继位的黎朝皇帝）、阮文惠一同会面，并同意后黎朝继续管治北方，之后阮文岳带着弟弟阮文惠一同南返。

哥哥开始担心弟弟势力过大，弟弟也对哥哥开始不满，不久双方爆发内战。阮氏内战的时候，北方权臣郑氏再次起来把持被西山朝允许统治北方的黎朝大权，阮文惠再次北伐，也就是这次北伐引来了满清的介入，击败满清后被满清册封为安南国王，借此机会，阮文惠彻底断绝跟哥哥阮文岳的君臣关系，自称皇帝。

这时候西山朝分裂成南北两部分，大哥阮文岳和弟弟阮文惠，各自为王。

兄弟内斗，给了原来割据南方的阮朝机会，流亡暹罗的阮朝宗室阮福映（阮主侄子）得到法国传教士和南方当地地主势力的支持，回到国内，夺回了嘉定（胡志明市）。在之后的岁月中，西山朝内斗激烈，无暇去管阮福映的事情，阮福映在嘉定一带卧薪尝胆，苦心经营，势力逐渐强大起来。

到了1792年，阮文惠去世，阮文惠的儿子阮光缵继位，称“景盛帝”，尊阮文惠为“太祖武皇帝”。阮光缵对农民起义军的军事政权，进行了一定的改革，大量任用了旧时代黎朝的文武官员，还将起义军的将领们加官进爵，将农民政权转化为一个传统的王朝政权，总体来说稳固了政权。

此时嘉定（胡志明市）的阮福映已经兵强马壮，开始北伐，率军包围阮文岳国都归仁，阮文岳遣人向在北方称帝割据的侄子阮光缵求救。

阮光缵派遣大将率步兵一万七千人、战象八十匹自陆路前去支援，又派水军分乘三十余艘战船入援归仁。阮福映见势强大，率兵撤回延庆府（庆和省延庆县），辗转回到嘉定（胡志明市）。

但阮光缵派兵击退阮福映之后，率军进入归仁，封锁了所有府库。西山起义的大哥阮文岳气愤而死，其子阮文宝被阮光缵封为孝公，号称小朝，食邑一邑，并派文臣监视其举动。

至此，西山起义中崛起的三股兄弟势力，由阮文惠的支系统一，此时他们面对的最大敌人，是他们早年推翻的越南南方阮朝，阮福映集团。

之后双方进行了长期的斗争，阮福映渐渐占据了上风。今年五月份再次北伐，攻占了西山朝首都富春（顺化），参与了此战的法国雇佣兵沙依诺描述，这是旧阮与西山朝之间爆发的最为惨烈的一战，战场上尸横遍野。西山军大败溃散，支持西山朝的华南海盗也遭到阮朝军队的沉重打击，重要海盗首领东海王莫观扶以及统兵梁文庚、樊文才被俘虏。

西山朝皇帝阮光缵率太宰阮光绍、元帅阮光卿、大司马阮文赐等人北逃，印章玺绶全被阮福映缴获。皇后黎氏玉萍也被俘虏。黎氏是前朝黎朝公主，所以西山朝要跟她联姻，阮福映俘虏她之后，也没有杀掉，同样跟她联姻，将黎玉萍纳为侍妾，册封为德妃。

如何对待这两个越南割据势力，周琅跟手下们商议过，虽然有乾隆册封西山朝的旧事，但大多数人还是支持阮朝。原因很简单，阮福映更像是一个明君。

阮福映趁西山朝内部分裂的机会，夺取嘉定之后，马上派阮文闲出使暹罗告捷，同时对暹罗此前的帮助表示感谢。阮福映在嘉定整顿内政，禁止赌博和巫术，同时重新划分了行政区域，制定了一系列法律，整顿税收和农耕。阮福映推行“寓兵于农”的政策，任命郑怀德、黎光定、吴从周、黄明庆等十二人为田畯官，劝课农桑、开垦荒地，征不愿务农者为兵。阮福映还积极发展对外贸易，购买国外金属